L’UAMSAT est pour l’instant, regroupée autour de deux principaux départements que sont le département de Sciences et Technologies et celui des Sciences de Gestion.
Les deux entités s’évertuent à rendre disponible un cadre d’études, de recherche et de création stimulant qui met la réussite des étudiants au premier plan.
Placés sous l’autorité du Président de l’Université, les départements sont gérés par les chefs de départements qui assurent la coordination des activités et des programmes, la promotion des filières (animation de la vie de la filière avec des conférences, visites), le suivi de l’édition des bulletins de notes et de la gestion des notes des étudiants relevant de leur département.
Le département Sciences de Gestion (SdG) assure la formation de cadres et des professionnels en apportant un socle de compétences solide en gestion et management.
Le département Sciences et technologies (S&T) se structure à la fois en unités disciplinaires fortes mais également autour d’axes transversaux pluridisciplinaires techniques et scientifiques.